More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4296 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
356 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 
352 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.88 
 
 
346 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.75 
 
 
353 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.28 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.01 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4756  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.16 
 
 
409 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.977722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
354 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  39.61 
 
 
352 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.43 
 
 
350 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  38.42 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.89 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.53 
 
 
356 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.82 
 
 
379 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.55 
 
 
358 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.73 
 
 
349 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.23 
 
 
349 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.2 
 
 
334 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.43 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
417 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
368 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.87 
 
 
395 aa  250  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
355 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.59 
 
 
357 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.54 
 
 
345 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
360 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
355 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.21 
 
 
357 aa  242  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.62 
 
 
347 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.16 
 
 
357 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.94 
 
 
370 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.51 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.51 
 
 
356 aa  238  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
350 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
334 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.03 
 
 
357 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.61 
 
 
345 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.61 
 
 
345 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.61 
 
 
345 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
352 aa  235  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.54 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.93 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  38.86 
 
 
357 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
353 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
356 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.67 
 
 
357 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
356 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.54 
 
 
394 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
357 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.96 
 
 
370 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.12 
 
 
360 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.71 
 
 
383 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
363 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
365 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.2 
 
 
414 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.94 
 
 
348 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.07 
 
 
376 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.2 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.32 
 
 
363 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.89 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
365 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
344 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
379 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  37.82 
 
 
365 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.42 
 
 
363 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.61 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.14 
 
 
363 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
343 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.23 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
383 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06844  mitochondrial 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12790)  35.97 
 
 
505 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.48 
 
 
383 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4702  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.94 
 
 
387 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.48 
 
 
383 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.78 
 
 
350 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2006  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40 
 
 
375 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.71 
 
 
350 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.66 
 
 
376 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.47 
 
 
359 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
354 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.28 
 
 
350 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.14 
 
 
348 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2744  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.84 
 
 
370 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.662947  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.54 
 
 
351 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1482  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.28 
 
 
386 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328933  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1461  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.76 
 
 
387 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
371 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.86 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.37 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.33 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>