More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4680 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  100 
 
 
347 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  82.42 
 
 
360 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  74.42 
 
 
345 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  74.13 
 
 
345 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  74.13 
 
 
345 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  69.3 
 
 
345 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  54.6 
 
 
370 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.44 
 
 
334 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.94 
 
 
355 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.9 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.13 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.15 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.4 
 
 
357 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.15 
 
 
365 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.73 
 
 
357 aa  289  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.26 
 
 
359 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.02 
 
 
351 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.7 
 
 
395 aa  279  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
354 aa  275  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.69 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.15 
 
 
339 aa  272  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.56 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.61 
 
 
350 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.39 
 
 
350 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.43 
 
 
357 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.27 
 
 
357 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.82 
 
 
355 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.6 
 
 
353 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.55 
 
 
350 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.71 
 
 
350 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.55 
 
 
379 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.25 
 
 
356 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
346 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 
352 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.35 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.97 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.31 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.4 
 
 
353 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.01 
 
 
349 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.48 
 
 
360 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  36.13 
 
 
352 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 
354 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  36.13 
 
 
352 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.28 
 
 
348 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  39.18 
 
 
357 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
357 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.19 
 
 
356 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.95 
 
 
368 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.95 
 
 
356 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.57 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.16 
 
 
343 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 
358 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.56 
 
 
356 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.74 
 
 
347 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.82 
 
 
350 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
343 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.32 
 
 
350 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.47 
 
 
351 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.17 
 
 
351 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.76 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.68 
 
 
351 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4756  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
409 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.977722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.11 
 
 
351 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.59 
 
 
351 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.59 
 
 
351 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.98 
 
 
349 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.05 
 
 
348 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
335 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
386 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.59 
 
 
351 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.01 
 
 
351 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.66 
 
 
444 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.59 
 
 
351 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.69 
 
 
350 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.15 
 
 
376 aa  225  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.18 
 
 
369 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
350 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.55 
 
 
363 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.89 
 
 
414 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.27 
 
 
363 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.22 
 
 
394 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.62 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
379 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
379 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
376 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 
363 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.64 
 
 
360 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.9 
 
 
345 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
355 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40 
 
 
382 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40 
 
 
382 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>