More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2127 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
331 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.29 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.57 
 
 
347 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.81 
 
 
357 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  48.47 
 
 
370 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.94 
 
 
417 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.9 
 
 
344 aa  245  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
334 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.48 
 
 
345 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.12 
 
 
357 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.18 
 
 
345 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.18 
 
 
345 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  46.88 
 
 
359 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.32 
 
 
345 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.61 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
365 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  37.65 
 
 
352 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  37.95 
 
 
352 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
353 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
346 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.51 
 
 
357 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.33 
 
 
351 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.34 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
353 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.92 
 
 
350 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.08 
 
 
379 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.48 
 
 
356 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.78 
 
 
356 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.61 
 
 
350 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.39 
 
 
357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.81 
 
 
357 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  36.81 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06844  mitochondrial 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12790)  39.23 
 
 
505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.21 
 
 
349 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.99 
 
 
357 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
356 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.21 
 
 
349 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.87 
 
 
368 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.95 
 
 
357 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.12 
 
 
356 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
348 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.8 
 
 
350 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
379 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.14 
 
 
383 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 
354 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
379 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.65 
 
 
355 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
379 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
379 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
383 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
383 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
350 aa  202  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.62 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.83 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 
370 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
350 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.09 
 
 
351 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.33 
 
 
444 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.39 
 
 
351 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.39 
 
 
351 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.1 
 
 
383 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.33 
 
 
386 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.87 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.72 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.72 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.52 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.53 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.11 
 
 
359 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.43 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.1 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.92 
 
 
351 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.21 
 
 
351 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.9 
 
 
356 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
352 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
365 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4756  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.07 
 
 
409 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.977722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.57 
 
 
368 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  36.63 
 
 
365 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05575  putative enoyl-coenzyme A hydratase protein  39.89 
 
 
390 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
343 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.29 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.7 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.31 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.29 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.54 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.29 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.8 
 
 
380 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.26 
 
 
355 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
344 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
343 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 
350 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.69 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.55 
 
 
363 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.35 
 
 
414 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
429 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>