More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1939 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
374 aa  773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.27 
 
 
372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.68 
 
 
386 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.54 
 
 
383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  62.73 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.54 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.54 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.27 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.27 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63 
 
 
383 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63 
 
 
389 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63 
 
 
382 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.42 
 
 
392 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.03 
 
 
381 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.86 
 
 
376 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  59.09 
 
 
368 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.39 
 
 
390 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.4 
 
 
368 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
376 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.07 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
391 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 
371 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
361 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.43 
 
 
367 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  39.79 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.03 
 
 
370 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  40.67 
 
 
379 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.12 
 
 
368 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.03 
 
 
368 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
390 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
427 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.1 
 
 
368 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.1 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
367 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.59 
 
 
367 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
423 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.47 
 
 
351 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.05 
 
 
414 aa  245  9e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.53 
 
 
413 aa  243  5e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.72 
 
 
375 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.44 
 
 
351 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.52 
 
 
351 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 
379 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.16 
 
 
351 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.25 
 
 
351 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
379 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
379 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.25 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.25 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.06 
 
 
351 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
379 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.06 
 
 
351 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
368 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 
376 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
367 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
350 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
360 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
379 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.33 
 
 
350 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.81 
 
 
383 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.15 
 
 
350 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
379 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.81 
 
 
429 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
379 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 
356 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  37.97 
 
 
357 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
356 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.73 
 
 
383 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.73 
 
 
383 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.47 
 
 
382 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.43 
 
 
383 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
357 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.17 
 
 
382 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.17 
 
 
382 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.17 
 
 
382 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.54 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.42 
 
 
365 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
346 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.68 
 
 
414 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
369 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
355 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.41 
 
 
369 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.66 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_003296  RS05575  putative enoyl-coenzyme A hydratase protein  37.33 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.46 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.52 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  38.81 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.55 
 
 
363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.24 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.29 
 
 
363 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
344 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.09 
 
 
376 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.52 
 
 
350 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  33.98 
 
 
352 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.03 
 
 
363 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
350 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>