More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0950 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
376 aa  783    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.85 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.92 
 
 
376 aa  359  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 
386 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.53 
 
 
372 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 
392 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.26 
 
 
368 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
376 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
374 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.89 
 
 
381 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.38 
 
 
383 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.38 
 
 
383 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.38 
 
 
382 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.84 
 
 
383 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.84 
 
 
389 aa  315  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.11 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.84 
 
 
383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.11 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.84 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 
374 aa  301  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.69 
 
 
391 aa  299  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  41.8 
 
 
379 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.48 
 
 
368 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
371 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.12 
 
 
369 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.58 
 
 
368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  41.21 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
370 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
367 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
367 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
367 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
367 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  38.73 
 
 
394 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
370 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
375 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 
368 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.25 
 
 
351 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.17 
 
 
351 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.71 
 
 
351 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.98 
 
 
351 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.58 
 
 
376 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.61 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.61 
 
 
351 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.61 
 
 
351 aa  235  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.61 
 
 
351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.61 
 
 
351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 
350 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.6 
 
 
350 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
427 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
356 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
369 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
356 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 
360 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.28 
 
 
376 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
383 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.75 
 
 
350 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.05 
 
 
413 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
379 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
379 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
414 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
355 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
379 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 
379 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
346 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  34.1 
 
 
357 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
379 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
379 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
379 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.33 
 
 
360 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
357 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.6 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1482  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.67 
 
 
386 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328933  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.2 
 
 
383 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1461  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.13 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.78 
 
 
414 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.56 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.56 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.56 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
376 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4702  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.33 
 
 
387 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2504  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.87 
 
 
380 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.7 
 
 
363 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.44 
 
 
382 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1833  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
380 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1244  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
380 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.877663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1985  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
380 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0387  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
391 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0775  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
391 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1536  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.88 
 
 
387 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1729  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
391 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1816  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
380 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.521456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05575  putative enoyl-coenzyme A hydratase protein  36.22 
 
 
390 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  36.63 
 
 
365 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>