More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0298 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
427 aa  892    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.15 
 
 
414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  64.6 
 
 
413 aa  514  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.93 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.71 
 
 
371 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
369 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.05 
 
 
391 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.34 
 
 
374 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 
361 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.77 
 
 
390 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 
390 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.58 
 
 
386 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.72 
 
 
392 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.77 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 
383 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.21 
 
 
389 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.4 
 
 
383 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.24 
 
 
383 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.97 
 
 
383 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.97 
 
 
383 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
372 aa  245  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.53 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.19 
 
 
368 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
376 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.49 
 
 
367 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
376 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.9 
 
 
368 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 
367 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 
367 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.32 
 
 
368 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
368 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
368 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
370 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 
375 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
367 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.47 
 
 
360 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
370 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  35.36 
 
 
379 aa  216  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.01 
 
 
374 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  34.44 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.92 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
368 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.64 
 
 
356 aa  213  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
376 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.45 
 
 
351 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
369 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
356 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
355 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.69 
 
 
383 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
350 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.97 
 
 
351 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
357 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  35.34 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.66 
 
 
351 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.4 
 
 
351 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.44 
 
 
346 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.66 
 
 
351 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.13 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.84 
 
 
351 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.84 
 
 
351 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.84 
 
 
351 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.42 
 
 
379 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.61 
 
 
350 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.15 
 
 
379 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 
379 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.55 
 
 
350 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
379 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.57 
 
 
360 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.96 
 
 
363 aa  183  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.68 
 
 
376 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33 
 
 
376 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 
352 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.42 
 
 
369 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.24 
 
 
383 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.7 
 
 
363 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
348 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.89 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.65 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
353 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
365 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.81 
 
 
363 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
353 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.38 
 
 
352 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
363 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
379 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
379 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.1 
 
 
380 aa  176  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  32.33 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.79 
 
 
357 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>