More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4309 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
368 aa  744    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.18 
 
 
368 aa  740    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.58 
 
 
368 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.92 
 
 
368 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.37 
 
 
370 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.57 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.85 
 
 
367 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.67 
 
 
367 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.4 
 
 
367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.6 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.01 
 
 
386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.74 
 
 
383 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.29 
 
 
382 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.17 
 
 
391 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.75 
 
 
376 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
376 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.21 
 
 
389 aa  279  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.63 
 
 
368 aa  278  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 
361 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
383 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.9 
 
 
392 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.47 
 
 
376 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.03 
 
 
374 aa  270  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  41.46 
 
 
379 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 
390 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.85 
 
 
375 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.21 
 
 
368 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.1 
 
 
374 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.67 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.06 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  38.48 
 
 
394 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
372 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.6 
 
 
369 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.95 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
368 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
423 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 
360 aa  238  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  40.47 
 
 
357 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
357 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
356 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.42 
 
 
413 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.23 
 
 
356 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
414 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.49 
 
 
376 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.35 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2556  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.29 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.02 
 
 
363 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1652  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.5 
 
 
376 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49047  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
355 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.94 
 
 
344 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.93 
 
 
394 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.95 
 
 
376 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.01 
 
 
383 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.18 
 
 
356 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
379 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  40.18 
 
 
365 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
379 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
383 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
379 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
379 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.29 
 
 
351 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.67 
 
 
360 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.84 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
363 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.55 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.13 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
351 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
379 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.64 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.64 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.27 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.01 
 
 
379 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.01 
 
 
379 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
345 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
351 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.02 
 
 
350 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
351 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
351 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
351 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.12 
 
 
351 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.99 
 
 
383 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.99 
 
 
383 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2998  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.35 
 
 
363 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2006  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.42 
 
 
375 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.97 
 
 
414 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.08 
 
 
379 aa  189  8e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.25 
 
 
369 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.89 
 
 
382 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.89 
 
 
382 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.89 
 
 
382 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
429 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>