More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2845 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2845  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  91.18 
 
 		 239 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2319  dithiobiotin synthetase  92.44 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0506133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2933  dithiobiotin synthetase  92.44 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2948  dithiobiotin synthetase  91.21 
 
 		 239 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  90.76 
 
 		 239 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2982  dithiobiotin synthetase  94.56 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  71.37 
 
 		 247 aa  334  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  72.22 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  79.74 
 
 		 240 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  79.74 
 
 		 240 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  79.74 
 
 		 240 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0338  dithiobiotin synthetase  78.72 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2016  dithiobiotin synthetase  78.85 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0102  dithiobiotin synthetase  78.85 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.545231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0171  dithiobiotin synthetase  70.89 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3078  dithiobiotin synthetase  78.85 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2270  dithiobiotin synthetase  78.85 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  53.64 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  56.02 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  57.14 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  54.11 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  56.28 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  53.44 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  50.72 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  54.39 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  47.62 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  48.21 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1479  dithiobiotin synthetase  56.28 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324532  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  51.17 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  51.89 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  45.26 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  46.49 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  44.83 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  44.4 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  44.4 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  48.67 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  46.43 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  43.97 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  47.06 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  47.09 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  44.84 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  50.72 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  47.62 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  47.3 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  44.39 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  45.74 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  41.67 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  40.24 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3842  dethiobiotin synthase  52.72 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  43.06 
 
 		 287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  42.73 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  42.6 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  42.6 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  38.77 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  42.15 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  48.34 
 
 		 270 aa  161  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  39.91 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  46.75 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  44.65 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  38.77 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  50.7 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  47.64 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  45.12 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  45.12 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  45.12 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  45.12 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  45.12 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  45.12 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  44.65 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  44.65 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  40.65 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  39.73 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  49.74 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  43.52 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  40.16 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  48.88 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  43.75 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  40.08 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  38.39 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  38.39 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  40.71 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  37.39 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  36.84 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  41.85 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  39.75 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  43.86 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  45.5 
 
 		 228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  40.27 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  39.73 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  43.86 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  41.85 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  40.89 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>