More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3842 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3842  dethiobiotin synthase  100 
 
 
194 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  74.09 
 
 
233 aa  266  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  69.63 
 
 
232 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  68.28 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  60.45 
 
 
266 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  53.14 
 
 
228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  57.78 
 
 
248 aa  170  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  53.26 
 
 
239 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  52.22 
 
 
226 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  51.37 
 
 
245 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  51.7 
 
 
247 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1479  dithiobiotin synthetase  56.98 
 
 
229 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324532  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  51.74 
 
 
230 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  44.44 
 
 
238 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  44.57 
 
 
221 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  53.33 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  51.65 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  48.33 
 
 
243 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  52.22 
 
 
235 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 
231 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  41.21 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  41.57 
 
 
231 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  49.73 
 
 
240 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  46.51 
 
 
228 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  41.28 
 
 
225 aa  138  6e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  45.66 
 
 
228 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  45.71 
 
 
226 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  41.76 
 
 
231 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  46.29 
 
 
226 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  46.29 
 
 
226 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  42.78 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  46.55 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  44.19 
 
 
227 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 
225 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  45.86 
 
 
231 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  46.2 
 
 
226 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  45.14 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  40.91 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0171  dithiobiotin synthetase  51.87 
 
 
239 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  40.57 
 
 
242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  45.03 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  44.19 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 
225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  46.2 
 
 
230 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  41.52 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  44.44 
 
 
225 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  44.44 
 
 
225 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 
225 aa  131  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  53.11 
 
 
239 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 
225 aa  131  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  46.74 
 
 
236 aa  131  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  45.61 
 
 
228 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  45.61 
 
 
228 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  45.03 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  43.86 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  44.77 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  43.86 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  45.61 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  41.99 
 
 
230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  42.61 
 
 
226 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  46.2 
 
 
226 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  42.61 
 
 
227 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  48.62 
 
 
237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  44.28 
 
 
237 aa  128  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  43.35 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  38.55 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  39.04 
 
 
287 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  42.93 
 
 
233 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  41.28 
 
 
240 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  41.28 
 
 
240 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  50 
 
 
270 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  41.28 
 
 
245 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  41.86 
 
 
226 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  39.13 
 
 
222 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  39.13 
 
 
222 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  50 
 
 
227 aa  121  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 
222 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 
235 aa  121  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  39.55 
 
 
247 aa  121  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  40.35 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  39.57 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  40.46 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2982  dithiobiotin synthetase  54.55 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2016  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  47.98 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0102  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.545231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2270  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2845  dithiobiotin synthetase  53.93 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3078  dithiobiotin synthetase  55.56 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  44.32 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2319  dithiobiotin synthetase  53.41 
 
 
239 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0506133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2933  dithiobiotin synthetase  53.41 
 
 
239 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2948  dithiobiotin synthetase  52.84 
 
 
239 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  40.22 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  39.77 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  38.73 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  39.77 
 
 
246 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>