103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0759 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  97.93 
 
 
193 aa  340  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  87.31 
 
 
197 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  60.42 
 
 
191 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  67.54 
 
 
187 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  65.78 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  70.55 
 
 
192 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  68.49 
 
 
190 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  67.12 
 
 
190 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  68.49 
 
 
294 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  67.81 
 
 
192 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  67.81 
 
 
192 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  67.81 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  41.38 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  38.98 
 
 
187 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  35.8 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  40.41 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  30.5 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  33.68 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  33.68 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  35.15 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  32.37 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  34.76 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  29.95 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  30.94 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  34.42 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  33.54 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  28.25 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  33.58 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  32.93 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  27.45 
 
 
173 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  31.65 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  29.52 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  30.86 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  28.57 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  28.57 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  27.78 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  27.87 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  28.47 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  30.6 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  31.79 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  27.27 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  30.43 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  30.43 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  31.67 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  31.91 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  24.59 
 
 
179 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  27.05 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  29.08 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  32.89 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  28.67 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  26.24 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  25.53 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  28.37 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.2 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  24.18 
 
 
173 aa  51.2  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  29.29 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  31.09 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  29.85 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  29.69 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  28 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  32.06 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  30.3 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  25.34 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  28.87 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  26.95 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  25.93 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  27.86 
 
 
175 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  28.06 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  31.34 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  23.66 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  30.6 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  29.79 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  31.34 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  28.88 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  23.87 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  30.5 
 
 
174 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  30.97 
 
 
170 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  30.83 
 
 
174 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>