133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3624 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  63.74 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  66.86 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  62.64 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  56.57 
 
 		 175 aa  200  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  57.31 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  55.75 
 
 		 175 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  59.75 
 
 		 180 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  53.76 
 
 		 175 aa  190  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  52.97 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  58.64 
 
 		 181 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  53.18 
 
 		 175 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  58.02 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  51.41 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  50.87 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  48.28 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  46.72 
 
 		 163 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  38.36 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  34.03 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  41.73 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  38.89 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  36.52 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  43.24 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  42.28 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  37.65 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  38.51 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  38.06 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  41.04 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  40.74 
 
 		 216 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  37.31 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  35.16 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  37.31 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  41.41 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  34.81 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  36.18 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  36.18 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  31.07 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  41.73 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  36.57 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  36.18 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  34.81 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  32.04 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  35.62 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  36.49 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  41.01 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  35.82 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  41.53 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  33.12 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  32.04 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  32.28 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  36.26 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  35.81 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  34.56 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  33.97 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  31.87 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  36.3 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  35.4 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  31.43 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  29.2 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  35.82 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  32.59 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  32.59 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  35.04 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  34.31 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0076  hypothetical protein  40.94 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  32.59 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  32.59 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  32.33 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  27.33 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  31.88 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  29.21 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  38.46 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  31.16 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  33.08 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  31.69 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  31.69 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  34.33 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  36.99 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  36.99 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2994  hypothetical protein  25.69 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0877174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  29.2 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  29.46 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  40.98 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  27.91 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  27.41 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>