58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4196 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  65.14 
 
 		 175 aa  227  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  66.09 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  69.8 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  63.79 
 
 		 173 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  62.65 
 
 		 173 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  60.84 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  64.86 
 
 		 173 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  61.59 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  44.57 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  48.98 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  45.86 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  45.21 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  45.21 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  45.21 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  45.21 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  45.21 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  45.21 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  47.18 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  46.43 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  45.21 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  43.54 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  30.3 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  32.35 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  35.61 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  31.62 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  29.58 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  27.06 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  30.99 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  28.03 
 
 		 322 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  32.61 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  27.44 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  28.03 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  34.38 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  25.68 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  31.88 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  32.33 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  26.39 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  28.42 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  25.95 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  26 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  26.52 
 
 		 302 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  26.63 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  25.9 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  28.95 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  24.86 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  30.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  30.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  30.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  30.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  24.29 
 
 		 173 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  24.52 
 
 		 191 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  30.83 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  26.43 
 
 		 178 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  30.83 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  28.15 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  29.31 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>