57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4792 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  343  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  91.91 
 
 		 173 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  66.46 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  62.43 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  67.32 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  60.84 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  61.69 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  61.01 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  65.99 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  47.55 
 
 		 178 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  45.95 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  45.95 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  45.95 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  45.95 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  45.95 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  45.95 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  43.6 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  46.26 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  45.27 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  42.44 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  47.26 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  46.51 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  33.57 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  33.33 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  26.83 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  35.95 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  32.16 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  28.14 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  28.14 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  28.14 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  32.9 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  29.65 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  29.7 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  28.49 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  27.59 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  28.93 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  28.1 
 
 		 204 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  28.3 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  32.98 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  29.27 
 
 		 318 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  24.69 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  32.93 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  28.46 
 
 		 302 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  30.2 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  30.92 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  30.7 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  30.6 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  26.92 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  24.09 
 
 		 208 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  26.8 
 
 		 176 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  27.56 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  32.93 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>