72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0900 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  96.98 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  72.28 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0910  hypothetical protein  45.16 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  43.08 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  35.61 
 
 		 187 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  36.03 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  33.69 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  34.06 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.53 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  31.76 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  31.76 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  31.18 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  30.71 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  29.85 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  28.28 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  30.66 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  29.1 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  31.43 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  29.21 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  31.34 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  30.15 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  30.15 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  32.56 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  32.35 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  30.66 
 
 		 176 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  34.07 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  29.63 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  29.01 
 
 		 166 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  25.76 
 
 		 200 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  31.39 
 
 		 179 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  28.23 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  29.84 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  30.66 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  30.3 
 
 		 194 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  31.88 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  30.15 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  28.89 
 
 		 172 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  35.04 
 
 		 181 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  30.15 
 
 		 174 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  29.01 
 
 		 170 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  32.31 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  29.75 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  31.11 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  28.47 
 
 		 176 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0882  hypothetical protein  23.74 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  29.32 
 
 		 185 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  31.87 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  30.09 
 
 		 173 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  26.72 
 
 		 163 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2966  hypothetical protein  29.63 
 
 		 174 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204675  normal  0.0956768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>