27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2966 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2966  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204675  normal  0.0956768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6141  hypothetical protein  81.03 
 
 		 174 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2607  outer membrane protein  81.03 
 
 		 174 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  30.88 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  30.23 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.84 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  28.89 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  26.24 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  27.39 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  24.39 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  20.69 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  22.56 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  31.67 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  25.71 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  28.03 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  29.84 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  27.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  24.79 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  31.67 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  23.73 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  24.79 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  37.88 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  21.95 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  25.6 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  25.29 
 
 		 175 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  32.67 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>