34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6141 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6141  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2607  outer membrane protein  99.43 
 
 		 174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2966  hypothetical protein  81.03 
 
 		 174 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204675  normal  0.0956768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  33.86 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  29.7 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  30.5 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  30.38 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  27.5 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  24 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  26.44 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  26.24 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  27.71 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  25.93 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  24.41 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  29.17 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  27.21 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  32.84 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  31.97 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  31.97 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  31.97 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  31.15 
 
 		 208 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  24.41 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  24.41 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  29.17 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  29.57 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  21.01 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  27.83 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.08 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  27.83 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  28.83 
 
 		 204 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  28.83 
 
 		 204 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  28.83 
 
 		 204 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>