122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4380 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  87.25 
 
 		 208 aa  334  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  75.94 
 
 		 203 aa  285  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  67.88 
 
 		 214 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  71.75 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  71.24 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  54.07 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  54.07 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  54.07 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  48.76 
 
 		 203 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  55.56 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  48.26 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  49.72 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  42.65 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  42.65 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  36.22 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  38.52 
 
 		 170 aa  98.6  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  42.22 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  41.04 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  41.04 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  35.51 
 
 		 185 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  35.92 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  31.79 
 
 		 194 aa  85.1  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  32.99 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  34.67 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  32.64 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  35 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  31.98 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  34.23 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  34.81 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  38.3 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  34.81 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  35.93 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  28.42 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  30.82 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  37.25 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  38.41 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  32.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  35.15 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  33.57 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  34.03 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  34.07 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  34.78 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  36.15 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  29.38 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  34.36 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  34.36 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  34.36 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  34.36 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  30.71 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  34.36 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  34.78 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  31.97 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  35.43 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  30.71 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  31.21 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  32.84 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  29.25 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  31.29 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  30.22 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  34.07 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  30.94 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  32.59 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  35.38 
 
 		 167 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.56 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  28.5 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  31.62 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  31.22 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  30.15 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  31.62 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  32.14 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  32.61 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0673  hypothetical protein  28.68 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.944503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  31.29 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  29.5 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  28.32 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  29.2 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  30.94 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  32.61 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  31.88 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  31.51 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2425  hypothetical protein  31.39 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  29.63 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  24.81 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  28.89 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  30.37 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>