122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4259 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  95.79 
 
 
214 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  72.32 
 
 
208 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  75.29 
 
 
203 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  71.75 
 
 
212 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  71.75 
 
 
212 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  67.97 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  53.63 
 
 
201 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  47.54 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  47.78 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  47.78 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  45.35 
 
 
204 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  45.35 
 
 
204 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  45.35 
 
 
204 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  38.13 
 
 
179 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  38.13 
 
 
179 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  34.68 
 
 
207 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  37.76 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  37.68 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  35.29 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  34.31 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  34.75 
 
 
169 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  30.94 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  31.43 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  34.75 
 
 
169 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  32.39 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  31.63 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  35.92 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  28.5 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  32.24 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  37.59 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  36.84 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  32.93 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  37.23 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  31.65 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  33.09 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  29.88 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  32.85 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  31.88 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  28.68 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  34.31 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  33.58 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  34.27 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  31.88 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  33.58 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  33.58 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  33.58 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  35.04 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  33.58 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  29.85 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  27.59 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  29.85 
 
 
322 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  32.61 
 
 
167 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  31.16 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  29.5 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  29.17 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  32.91 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  30.07 
 
 
169 aa  62.4  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  24.46 
 
 
191 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  28.57 
 
 
172 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  25.93 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  28.35 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  31.94 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  29.1 
 
 
302 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  24.63 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  32.12 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  32.12 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  25.74 
 
 
200 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  26.85 
 
 
183 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  31.08 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  26.53 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  30.43 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  29.71 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.1 
 
 
163 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  29.71 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  33.06 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  31.85 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0673  hypothetical protein  27.94 
 
 
184 aa  55.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.944503  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  33.02 
 
 
174 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  29.2 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  27.17 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  27.86 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  26.92 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  28.91 
 
 
167 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  27.61 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  27.61 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>