155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3445 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  90.75 
 
 		 173 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  46.04 
 
 		 214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  47.69 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  40.72 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  47.45 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  41.33 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  42.36 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  44.2 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  42.45 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  41.78 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  41.1 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  43.84 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  36.24 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  34.36 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  34.36 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  35.5 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  32.37 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  34.44 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  38.41 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  36.31 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  39.01 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  37.79 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  39.76 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  34.3 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  39.16 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  36.26 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  37.78 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  34.53 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  38.12 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  32 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  36.93 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  36.03 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  32.78 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  32.6 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  32.87 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  31.98 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  30.82 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  32.4 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  36.03 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  30.34 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  31.82 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  34.32 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  31.79 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  35.66 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  32.04 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  35.42 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  29.93 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  30.14 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  34.03 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  30.36 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  31.08 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  31.94 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  33.56 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  24.84 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  34.27 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  28.37 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  31.25 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  25.6 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  31.91 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  28.77 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  29.8 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  32.85 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  32.12 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  32.12 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  27.7 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  27.7 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  26.83 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  27.7 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  32.69 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  30.34 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0882  hypothetical protein  33.04 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  27.03 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  32.05 
 
 		 322 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  27.03 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  29.48 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  32.84 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  29.09 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  25.33 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  29.87 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  32.35 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  27.03 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  27.03 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  27.7 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>