35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0882 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0882  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0933  hypothetical protein  92.2 
 
 
219 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.085058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0930  hypothetical protein  92.2 
 
 
219 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0936  hypothetical protein  43.79 
 
 
232 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  35.43 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  35.07 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  24.58 
 
 
318 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  25.76 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  28 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  24.02 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  28.46 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  26.82 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  25.47 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  29.71 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  27.46 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  27.86 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  25.96 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  25.76 
 
 
189 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  26.67 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0910  hypothetical protein  23.84 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190788  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  27.14 
 
 
183 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  30.65 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  28.03 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  29.37 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  31.68 
 
 
182 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  30.23 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  24.08 
 
 
185 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  27.67 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  27.14 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  29.1 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  26.47 
 
 
175 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  27.82 
 
 
177 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  26.06 
 
 
175 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  35.8 
 
 
169 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>