35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0933 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.085058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0930  hypothetical protein  99.09 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0882  hypothetical protein  92.2 
 
 		 218 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0936  hypothetical protein  43.79 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  34.65 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  32.28 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  32.84 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  24.58 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  24.39 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  26.82 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  28 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  23.89 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  25.47 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  27.86 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  28.99 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  27.69 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  26.76 
 
 		 175 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  32.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  28.03 
 
 		 175 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  24.76 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  25.17 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  27.67 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  23.81 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  22.73 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  26.76 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  25.87 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  23.76 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  29.01 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  27.91 
 
 		 226 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  29.84 
 
 		 190 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  26.06 
 
 		 175 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  27.74 
 
 		 176 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>