113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6258 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  71.23 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  66.87 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  65.99 
 
 		 182 aa  193  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  66.67 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  65.99 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  65.99 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  66.67 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  65.99 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  65.99 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  67.16 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  48.26 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  49.42 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  49.68 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  47.71 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  46.75 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  46.71 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  44.77 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  46.26 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  46.31 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  41.67 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  47.95 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  32.48 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  34.01 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  30.06 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.77 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  29.75 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  30.72 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  28.3 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  29.56 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  33.08 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  32.39 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  29.71 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  29.56 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  28.33 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  35.16 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  36.09 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  26.67 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  30.14 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  34.9 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  30.61 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  29.49 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  35.66 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  27.4 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  34.11 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  32.81 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  28.29 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  32.24 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  28.68 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  26.35 
 
 		 217 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  29.66 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  30.16 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  30.56 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  27.59 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  30.82 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  27.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  27.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  27.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  32.24 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  26.95 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  33.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  26.17 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  33.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  27.11 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  30.39 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  26.83 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  26.62 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  33.56 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  26.85 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  29.48 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  27.33 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  29.03 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  26.71 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  28.49 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  29.2 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  24.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  25.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  27.91 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  22.91 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  31.01 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0936  hypothetical protein  23.78 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  30.83 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  26.98 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  25 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  25 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  28.09 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  28.09 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  28.09 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  28.09 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  28.09 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>