103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3486 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  98.96 
 
 
192 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  91.15 
 
 
294 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  93.75 
 
 
192 aa  294  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  91.15 
 
 
190 aa  290  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  91.15 
 
 
190 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  62.11 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  64.58 
 
 
186 aa  218  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  71.23 
 
 
187 aa  214  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  65.66 
 
 
193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  66.25 
 
 
193 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  66.25 
 
 
193 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  66.25 
 
 
193 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  65.62 
 
 
193 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  66.67 
 
 
197 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  65.62 
 
 
193 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  39.04 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  35.06 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  37.14 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  35.62 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  29.95 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  33.11 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  28.21 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  31.64 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  33.58 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  32.85 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  32.7 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  31.43 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  31.43 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  28.06 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  32.93 
 
 
201 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  27.14 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  27.14 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  29.51 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  30.08 
 
 
226 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  28.78 
 
 
216 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  27.81 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  26.88 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  27.21 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  23.72 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  27.78 
 
 
179 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.73 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  27.78 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  26.42 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  26.42 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  28.24 
 
 
169 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  25.47 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  40.79 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  40.79 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  30.43 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  27.41 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  25.87 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  47.37 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  30.4 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  24.83 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  26.35 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  26.67 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  24.28 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  26.39 
 
 
202 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  28.66 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  30.4 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  28.23 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  29.6 
 
 
182 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  29.6 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  29.6 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  29.6 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  29.6 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  26.57 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  27.27 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  25 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  27.86 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  28.83 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  28.66 
 
 
174 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0936  hypothetical protein  25.95 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  25.88 
 
 
182 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  26.42 
 
 
183 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  28.12 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  28.89 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  27.15 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  24.79 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  33.08 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  29.36 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  26.4 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  23.97 
 
 
187 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  41.54 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.956984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>