83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3425 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  100 
 
 		 176 aa  345  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  60.8 
 
 		 174 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  59.32 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  59.66 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  57.87 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  58.58 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  56.25 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  60.78 
 
 		 173 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  59.74 
 
 		 163 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  43.18 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  50.34 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  43.68 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  48.3 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  44.59 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  48.87 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  44.59 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  44.59 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  41.61 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  32 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  35.53 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  35.53 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  32.57 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  30.83 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  27.07 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  33.79 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  33.11 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  27.32 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  26.35 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  29.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  27.97 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  27.33 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  27.33 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  32.89 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  30.41 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  34.56 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  27.94 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  29.71 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.5 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  29.73 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  33.82 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  26.97 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  33.02 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  30.18 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  40.62 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  27.94 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  29.73 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  29.53 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  31.46 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  29.53 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  29.53 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  28.26 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  28.86 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6141  hypothetical protein  30.15 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2607  outer membrane protein  30.15 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  29.58 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  32.04 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  29.79 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  41.46 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  27.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  29.93 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  27.41 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  26.67 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  31.13 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  27.89 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  43.1 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  31.97 
 
 		 208 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>