53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4881 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  91.91 
 
 		 173 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  66.47 
 
 		 175 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  63.86 
 
 		 173 aa  204  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  62.65 
 
 		 174 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  65.41 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  64.97 
 
 		 163 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  60.38 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  63.27 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  45.03 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  45.33 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  45.33 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  45.33 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  45.33 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  45.33 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  45.33 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  44.67 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  46.58 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  46.31 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  47.01 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  41.28 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  45.95 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  28.74 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  31.43 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  30.99 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  35.71 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  29.76 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  34.64 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  26.51 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  27.87 
 
 		 302 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  32.09 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  30.09 
 
 		 322 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  30.57 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  31.87 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  28.29 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  28.14 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  31.58 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  27.61 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  25.55 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  27.5 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  27.5 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  27.5 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  31.91 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.68 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  29.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  26.63 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  27.61 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  34.15 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  26.35 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  26.42 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  31.68 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>