80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0214 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  74.07 
 
 		 163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  68 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  68.79 
 
 		 173 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  66.09 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  67.05 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  62.43 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  65.41 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  63.82 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  44.51 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  43.64 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  51.13 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  46.36 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  46.36 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  46.36 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  46.36 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  46.36 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  46.36 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  46.36 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  50.68 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  47.3 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  33.99 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  38.62 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  36.6 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  38.85 
 
 		 216 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  34.97 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  33.09 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  34.22 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  35.25 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  27.48 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  34.78 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  32.35 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  32.92 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  32.12 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  28.78 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.71 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  26.81 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  32.88 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  29.08 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  32.31 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  27.97 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  31.4 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  27.34 
 
 		 322 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  23.57 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  30.85 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  33.08 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  39.24 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  32.67 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  25.78 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  32.67 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  32.67 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  31.37 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  32 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  28.48 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  33.94 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  29.46 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  32.48 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  27.45 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  34.55 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  30.23 
 
 		 197 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  38.67 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  29.66 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  38.67 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  38.67 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  24.48 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  32.56 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  29.13 
 
 		 294 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  34.46 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>