75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1527 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  97.88 
 
 		 236 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  97.88 
 
 		 236 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  67.51 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  62.34 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  63.55 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  32.23 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3766  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5233  hypothetical protein  28.05 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5308  hypothetical protein  29.75 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.969326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4766  hypothetical protein  29.34 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4061  hypothetical protein  28.85 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.507546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  37.18 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  37.97 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  37.78 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  46.67 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  43.48 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  25.64 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  40.58 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  30 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  27.78 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  36.51 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  26 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  47.37 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  47.37 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  47.37 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  45.61 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  30.56 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  47.37 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  38.18 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  38.16 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  36.99 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  31.17 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 166 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  43.86 
 
 		 191 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  51.52 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  51.52 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  44.68 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  34.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  48.72 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  27.22 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  37.7 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  39.68 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  35.29 
 
 		 167 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  28.46 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  33.78 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  38.78 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  43.59 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>