81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7491 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  328  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  74.07 
 
 
174 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  68.52 
 
 
175 aa  222  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  67.9 
 
 
173 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  69.8 
 
 
174 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  68.63 
 
 
173 aa  207  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  64.97 
 
 
173 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  61.69 
 
 
173 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  60.53 
 
 
176 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  54.48 
 
 
176 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  47.68 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  47.68 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  47.68 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  47.68 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  47.68 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  47.68 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  47.68 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  50 
 
 
183 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  45.58 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  50.68 
 
 
176 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  48.63 
 
 
183 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  45.1 
 
 
176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  35.94 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  34.38 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.46 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  27.27 
 
 
208 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  30.88 
 
 
179 aa  53.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.71 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  29.88 
 
 
169 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  30.25 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  31.51 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  31.51 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  34.06 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  28.17 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  32.87 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  29.55 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  43.68 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  32.26 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  30.58 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  31.61 
 
 
187 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  32.19 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  37.11 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  28.36 
 
 
216 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  27.61 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  32.71 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  34.74 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.69 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  31.13 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  35.56 
 
 
201 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  27.97 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  33.08 
 
 
190 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  31.78 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  26.52 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  29.86 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  33.08 
 
 
294 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  30.57 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  27.64 
 
 
302 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  30.08 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  35.44 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  26.77 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  30.16 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  26.62 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.34 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  33.08 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  33.08 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  33.08 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  23.33 
 
 
217 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  26.77 
 
 
322 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  33.07 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  33.07 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  33.07 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  33.07 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  26.77 
 
 
235 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  26.32 
 
 
204 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  33.07 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  29.46 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  27.59 
 
 
194 aa  40.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>