139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3148 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  61.08 
 
 
204 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  59.9 
 
 
203 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  58.91 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  58.91 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  59.41 
 
 
203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  58.42 
 
 
204 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  52.31 
 
 
214 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  52.02 
 
 
212 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  52.02 
 
 
212 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  56.67 
 
 
208 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  50.26 
 
 
214 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  57.99 
 
 
203 aa  187  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  54.25 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  40.67 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  45.86 
 
 
190 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  45.86 
 
 
174 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  43.61 
 
 
179 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  43.61 
 
 
179 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  34.75 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  36.43 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  33.17 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  37.04 
 
 
170 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  35.51 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  32.73 
 
 
187 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  33.82 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  37.23 
 
 
216 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  38.35 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  37.8 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  36.43 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  36.84 
 
 
166 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  37.01 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  37.59 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  29.53 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  33.8 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  33.33 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  36.69 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  38.81 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  34.29 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  36.77 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  31.25 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  32.68 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  31.29 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  33.09 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.46 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  33.57 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  30.73 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  33.58 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  32.45 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  31.08 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  32.35 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  34.27 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  30.71 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  28.35 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  32.59 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  29.06 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  33.58 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  29.63 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  30.92 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  31.29 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  31.29 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  29.85 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  31.29 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  29.93 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  31.88 
 
 
322 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  31.65 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  32.87 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  28.4 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  30.15 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  30.56 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  33.12 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  26.94 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  28.8 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  25.53 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  30.56 
 
 
294 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  28.35 
 
 
175 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  30.5 
 
 
302 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  29.85 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  25.77 
 
 
188 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  29.85 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  29.1 
 
 
165 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  29.1 
 
 
180 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  26.04 
 
 
186 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  32.62 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  29.45 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  24.41 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>