101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0840 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  89.06 
 
 
294 aa  298  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  93.75 
 
 
192 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  93.75 
 
 
192 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  92.71 
 
 
192 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  87.5 
 
 
190 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  87.5 
 
 
190 aa  277  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  70 
 
 
193 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  70 
 
 
193 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  69.28 
 
 
193 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  70 
 
 
193 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  59.47 
 
 
191 aa  221  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  69.38 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  64.58 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  69.38 
 
 
193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  71.23 
 
 
187 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  68.39 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  38.95 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  35.63 
 
 
187 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  36.61 
 
 
187 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  36.99 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  34.21 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  29.22 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  28.5 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  35.04 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  28.78 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  34.31 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  30.17 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  29.5 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  32.37 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  31.97 
 
 
226 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  31.79 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  27.86 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  28.47 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  28.47 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  31.71 
 
 
224 aa  61.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  27.86 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  31.17 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  27.81 
 
 
214 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  32.6 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.05 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  24.68 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  26.29 
 
 
235 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  29.71 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  27.46 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  27.46 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  30.27 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  27.46 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  26.47 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  25.95 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  29.03 
 
 
166 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  28.23 
 
 
166 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  26.43 
 
 
203 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  28.47 
 
 
179 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  39.47 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  39.47 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  45.61 
 
 
236 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  28.69 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  27.64 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  30.94 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  26.7 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  28.49 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  28.1 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  28.91 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  28.37 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  30.05 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  25.35 
 
 
202 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  27.66 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  27.38 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  28.8 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  29.6 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  25.93 
 
 
169 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  28.8 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  28.8 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  28.8 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  28.8 
 
 
179 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  31.19 
 
 
235 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  31.88 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  26.32 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0936  hypothetical protein  25.15 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  25.19 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  27.5 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  23.12 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  26.85 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  21.6 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  26.13 
 
 
183 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  24.79 
 
 
172 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  30.83 
 
 
615 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  27.78 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>