85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3670 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  72.87 
 
 		 186 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  68.42 
 
 		 187 aa  234  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  70.27 
 
 		 197 aa  213  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  66.88 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  68.49 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  67.12 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  66.88 
 
 		 193 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  66.44 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  66.44 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  66.44 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  65.07 
 
 		 294 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  64.38 
 
 		 192 aa  197  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  38.83 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  32.77 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  34.03 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  37.16 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  29.32 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  25.33 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  30.4 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  28.4 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  32.12 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  25 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  28.15 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  24.82 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  25.19 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.41 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  29.29 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  24.82 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  24.64 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  27.94 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  27.61 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  28.24 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  26.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  29.71 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  28.88 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  25.71 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  29.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  31.75 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  29.37 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  26.81 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  23.91 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  30.7 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  39.47 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  39.47 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  31.9 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  25.17 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  24.29 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  24.29 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  43.86 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  24.29 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  25.84 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  25.69 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  22.54 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  22.54 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  25.99 
 
 		 185 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  30.47 
 
 		 190 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  24.65 
 
 		 173 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  24.55 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  29.51 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  29.51 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>