113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1425 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  91.85 
 
 		 187 aa  309  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  73.94 
 
 		 191 aa  261  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  75.5 
 
 		 197 aa  221  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  72.96 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  72.3 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  71.62 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  72.33 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  72.33 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  72.33 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  72.3 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  72.3 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  71.7 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  72.3 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  70.27 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0759  hypothetical protein  71.7 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  70.27 
 
 		 294 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  46.15 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  41.21 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  40.65 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  42.14 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  32.12 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  32.12 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  31.47 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  31.47 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  27.84 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  29.88 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  30.18 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  30.18 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  30.18 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  29.79 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  33.08 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  31.41 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  29.46 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  33.96 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  34.53 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  28.26 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  34.59 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  30.28 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  28.8 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  30.43 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  29.46 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  32.47 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  32.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  26.22 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  24.65 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  33.06 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  32.02 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  28.31 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  37.7 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  30.07 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  28.4 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  33.86 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  28.18 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  28.15 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.41 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0083  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0959336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  39.47 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  39.47 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  29.91 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  28.74 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  30.54 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  31.19 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  27.74 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3764  hypothetical protein  31.09 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159393  normal  0.0312174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  28.69 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  29.46 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  29.46 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  29.46 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  29.46 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  33.61 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  28.87 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  26.92 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  28.69 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  31.62 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  40.3 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  30.14 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  28.87 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  31.36 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  27.01 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  23.36 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  27.14 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  26.09 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>