89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2116 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  98.57 
 
 
385 aa  286  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  98.57 
 
 
385 aa  286  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2116  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.638714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  97.86 
 
 
385 aa  283  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  90 
 
 
375 aa  260  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  89.29 
 
 
385 aa  260  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  90.71 
 
 
385 aa  247  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  88.57 
 
 
407 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  88.57 
 
 
407 aa  241  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  76.92 
 
 
388 aa  215  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  76.92 
 
 
388 aa  215  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  76.92 
 
 
388 aa  215  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  76.22 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  76.22 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  76.39 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  76.92 
 
 
389 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  75 
 
 
389 aa  208  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  72.92 
 
 
443 aa  205  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  62.76 
 
 
388 aa  179  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  62.07 
 
 
388 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  61.38 
 
 
388 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  60 
 
 
388 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  60.69 
 
 
388 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  60.69 
 
 
389 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  60.69 
 
 
388 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  60.69 
 
 
388 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  60.69 
 
 
388 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  60 
 
 
388 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  44.44 
 
 
720 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.69 
 
 
390 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.69 
 
 
414 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.97 
 
 
416 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  37.29 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  34.29 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  42.74 
 
 
366 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.05 
 
 
378 aa  78.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  40.16 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40 
 
 
415 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  36.75 
 
 
378 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  44 
 
 
383 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.65 
 
 
383 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.31 
 
 
399 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  36.96 
 
 
429 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  31.34 
 
 
409 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  39.66 
 
 
349 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  35.9 
 
 
381 aa  67  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.14 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  43.68 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  37.38 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  42.02 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.11 
 
 
411 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.82 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.56 
 
 
379 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.77 
 
 
421 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36 
 
 
378 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  36.29 
 
 
406 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  39 
 
 
459 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.06 
 
 
366 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.71 
 
 
442 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  36 
 
 
397 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4398  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.09 
 
 
680 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419571  decreased coverage  0.00211504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  37.76 
 
 
449 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.4 
 
 
514 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.74 
 
 
438 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.38 
 
 
420 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  36.36 
 
 
416 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  37.62 
 
 
380 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  27.35 
 
 
420 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  28.81 
 
 
374 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.25 
 
 
405 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  31.54 
 
 
378 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  34 
 
 
467 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  36.84 
 
 
371 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.25 
 
 
405 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.25 
 
 
405 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  35.79 
 
 
371 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  28.26 
 
 
382 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  31.71 
 
 
406 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 
383 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  30.84 
 
 
375 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  35.42 
 
 
369 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.21 
 
 
420 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.21 
 
 
420 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.23 
 
 
429 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  34.34 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  32.98 
 
 
351 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  35.64 
 
 
378 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.77 
 
 
364 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.28 
 
 
420 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>