164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6049 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6049  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3027  hypothetical protein  51.15 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0329935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1531  hypothetical protein  40.35 
 
 		 517 aa  362  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000022  uncharacterized protein ImpD  40.69 
 
 		 499 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2367  hypothetical protein  38.58 
 
 		 511 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.88 
 
 		 495 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.01 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  40.28 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  40.28 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  40.05 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  40.28 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  40.28 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  40.05 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  40.05 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  40.05 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  40.05 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  40.05 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  40.28 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.51 
 
 		 496 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  39.58 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  37.73 
 
 		 494 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  38.19 
 
 		 498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  37.96 
 
 		 493 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  40.09 
 
 		 494 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  39.63 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  39.63 
 
 		 494 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  36.34 
 
 		 499 aa  292  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  37.3 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  39.68 
 
 		 493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  36.01 
 
 		 494 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  35.09 
 
 		 491 aa  289  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  37.07 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  36.84 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  37.07 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1732  hypothetical protein  37.44 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.473606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  36.16 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.3 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  36.9 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3071  hypothetical protein  39.96 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  36.63 
 
 		 499 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5979  EvpB family type VI secretion protein  36.88 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3072  hypothetical protein  35.01 
 
 		 497 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  36.7 
 
 		 497 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  36.78 
 
 		 500 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  36.45 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  36.45 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0454  hypothetical protein  37.39 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  36.45 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  35.83 
 
 		 498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  37.33 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  36.45 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1587  hypothetical protein  36.43 
 
 		 502 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  35.42 
 
 		 502 aa  267  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  36.22 
 
 		 497 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  35.86 
 
 		 498 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  36.61 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  36.61 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1910  hypothetical protein  36.38 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  36.38 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1209  hypothetical protein  36.38 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2184  hypothetical protein  36.38 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1694  hypothetical protein  36.38 
 
 		 530 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  36.45 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  36.67 
 
 		 497 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3564  EvpB family type VI secretion protein  34.77 
 
 		 503 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  34.77 
 
 		 500 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0762  hypothetical protein  34.77 
 
 		 500 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.277703  normal  0.125026 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  35.93 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  35.7 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2368  hypothetical protein  32.95 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  35.93 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  35.93 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  36.32 
 
 		 497 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3027  EvpB family type VI secretion protein  36.34 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3475  hypothetical protein  35.62 
 
 		 497 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00265  SciI protein  35.45 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6674  EvpB family type VI secretion protein  35.96 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585519  normal  0.849864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0156  hypothetical protein  34.16 
 
 		 498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  31.44 
 
 		 513 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3040  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  34.55 
 
 		 506 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01020  hypothetical protein  33.94 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  33.26 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0300  EvpB family type VI secretion protein  34.7 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0297  SciI protein  34.7 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.770201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0312  type VI secretion protein, EvpB/family  34.7 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0306  type VI secretion protein, EvpB/family  34.7 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  31.36 
 
 		 491 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  34.33 
 
 		 504 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  32.36 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  31.66 
 
 		 516 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0940  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  35.39 
 
 		 499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000021  uncharacterized protein ImpC  31.18 
 
 		 497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.147425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  33.41 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  31.28 
 
 		 492 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>