164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1531 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1531  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1077    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2367  hypothetical protein  47.06 
 
 
511 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000022  uncharacterized protein ImpD  41.53 
 
 
499 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507216  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6049  hypothetical protein  40.87 
 
 
455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  38.95 
 
 
498 aa  355  8.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  40.99 
 
 
499 aa  355  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3072  hypothetical protein  38.15 
 
 
497 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  40.95 
 
 
494 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  41.72 
 
 
500 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  41.72 
 
 
500 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  41.72 
 
 
500 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  41.51 
 
 
500 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  41.29 
 
 
500 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.5 
 
 
495 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.5 
 
 
495 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  37.73 
 
 
494 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  40.05 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  40.5 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  40.5 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  40.5 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  40.5 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2368  hypothetical protein  38.01 
 
 
497 aa  336  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  40.27 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  40.27 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  40.27 
 
 
496 aa  336  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  40.5 
 
 
496 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  38.43 
 
 
496 aa  335  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  40.5 
 
 
496 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  40.5 
 
 
496 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  36.36 
 
 
493 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.27 
 
 
496 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  33.87 
 
 
491 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  40.77 
 
 
494 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  38.72 
 
 
500 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  37.72 
 
 
499 aa  317  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  36.54 
 
 
497 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  37.81 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000021  uncharacterized protein ImpC  35.84 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.147425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  38.95 
 
 
494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  39.86 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  38.95 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  38.77 
 
 
497 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.47 
 
 
497 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  36.75 
 
 
499 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  38.55 
 
 
497 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  37.67 
 
 
500 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  37.67 
 
 
500 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  37.67 
 
 
500 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5979  EvpB family type VI secretion protein  38.17 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1732  hypothetical protein  37.72 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.473606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1587  hypothetical protein  38.03 
 
 
502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3071  hypothetical protein  36.88 
 
 
497 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  37.89 
 
 
499 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  37.89 
 
 
499 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  38.03 
 
 
502 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  37.89 
 
 
499 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  37.89 
 
 
499 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3027  hypothetical protein  39.24 
 
 
465 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0329935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.17 
 
 
502 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0762  hypothetical protein  37.1 
 
 
500 aa  300  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.277703  normal  0.125026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  37.1 
 
 
500 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3564  EvpB family type VI secretion protein  37.1 
 
 
503 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0454  hypothetical protein  37.58 
 
 
502 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  35.63 
 
 
501 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  34.89 
 
 
498 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0156  hypothetical protein  36.02 
 
 
498 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  38.05 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01020  hypothetical protein  35.82 
 
 
498 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6674  EvpB family type VI secretion protein  37.67 
 
 
499 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585519  normal  0.849864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  37 
 
 
497 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3027  EvpB family type VI secretion protein  37.89 
 
 
499 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3475  hypothetical protein  38.11 
 
 
497 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00265  SciI protein  36.78 
 
 
500 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0312  type VI secretion protein, EvpB/family  37.44 
 
 
502 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0306  type VI secretion protein, EvpB/family  37.44 
 
 
502 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44726  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0300  EvpB family type VI secretion protein  37.44 
 
 
502 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0297  SciI protein  37.44 
 
 
502 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.770201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  36.34 
 
 
499 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  36.34 
 
 
499 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1910  hypothetical protein  36.12 
 
 
499 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1694  hypothetical protein  36.12 
 
 
530 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  36.12 
 
 
499 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1209  hypothetical protein  36.12 
 
 
499 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2184  hypothetical protein  36.12 
 
 
499 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2444  hypothetical protein  34.9 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3040  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  35.78 
 
 
506 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0940  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.67 
 
 
499 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205966  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1900  hypothetical protein  34.46 
 
 
501 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0439  hypothetical protein  34.46 
 
 
503 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2075  hypothetical protein  34.46 
 
 
501 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0748  hypothetical protein  34.46 
 
 
501 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1043  hypothetical protein  34.46 
 
 
501 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0701  hypothetical protein  34.46 
 
 
501 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2017  hypothetical protein  34.46 
 
 
501 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>