63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1085 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  100 
 
 		 123 aa  248  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  47.97 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  43.7 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  42.5 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  38.46 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  47.62 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  42.27 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  38.14 
 
 		 461 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  39.29 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  36.44 
 
 		 461 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  42.16 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.59 
 
 		 461 aa  83.6  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.5 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  36 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  33.91 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.92 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  39.25 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.51 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  31.53 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.33 
 
 		 537 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  38.54 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  38.46 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  34.34 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  38.27 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  38.27 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.62 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  38.82 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  37.31 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1196  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.33 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.233387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0201  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.41 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  32.99 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  32.99 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  34.02 
 
 		 200 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  34.62 
 
 		 208 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0630  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.73 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.04 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1625  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.73 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3191  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.73 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  30.77 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.98 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.7 
 
 		 571 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0911  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.52 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.81 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  34.12 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.74 
 
 		 486 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  36.62 
 
 		 561 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.87 
 
 		 161 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.57 
 
 		 204 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.88 
 
 		 274 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  35.38 
 
 		 290 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.78 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.31 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  38.81 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  32.84 
 
 		 200 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0392  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  31.71 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.31 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0788  NADH dehydrogenase I, C subunit  35.71 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  35.82 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  37.31 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0376  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.95 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.224018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  31.34 
 
 		 200 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.39 
 
 		 374 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>