21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1670 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  100 
 
 		 155 aa  328  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  32.17 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  29.79 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.14 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  28.86 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  30.2 
 
 		 461 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.51 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  34.71 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  29.82 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  26.96 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  29.29 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  29.46 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  31.15 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  27.97 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  30 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  27.83 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  32.65 
 
 		 245 aa  40.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>