24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0149 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  100 
 
 		 113 aa  229  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  47.62 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  41.59 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.47 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  42.42 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  40.86 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.22 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  45.74 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  41.94 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  37.86 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  40 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  40.18 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  39.29 
 
 		 461 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  35.79 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  39.36 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.39 
 
 		 461 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  36.7 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.71 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  34.74 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  36.46 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  38.24 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  33.65 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  31.31 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1196  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.23 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.233387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>