43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3368 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  50.89 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  41.59 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  34.96 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  37.07 
 
 		 461 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  35.59 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  35.34 
 
 		 461 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  40.4 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.21 
 
 		 461 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  38.38 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  32.79 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.14 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  34.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  37.23 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  38.78 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  35.96 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  44.44 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  36 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  31.52 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  33.01 
 
 		 200 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  33.01 
 
 		 200 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0201  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  30 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  29.7 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  32.04 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  25.84 
 
 		 537 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1196  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.68 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.233387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  28.42 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  31.58 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  28.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1884  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.75 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  32.18 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  33.93 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  25.71 
 
 		 148 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  34.12 
 
 		 290 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  31.71 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.95 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.68 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  29.41 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  26.5 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>