24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1733 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  47.17 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  53.39 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  42.06 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  40.87 
 
 		 151 aa  85.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.29 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.74 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.96 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  38.46 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.23 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  36.11 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  36.46 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  28.57 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  27.03 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  31.3 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  40 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  32.69 
 
 		 461 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  31.73 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  31.87 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.73 
 
 		 461 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 531 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  40.54 
 
 		 537 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>