33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0552 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  243  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  45.13 
 
 
120 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.81 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  44.44 
 
 
461 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  43.52 
 
 
461 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.08 
 
 
461 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  42.34 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.58 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  37.08 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.08 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  37.86 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  35.35 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.48 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  35.96 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  31.31 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  35.79 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  36.84 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  33.33 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  31.68 
 
 
245 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.29 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  36.56 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.56 
 
 
486 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  33.98 
 
 
148 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2228  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.13 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310199  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.56 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0116272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2589  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.63 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.89 
 
 
537 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0674  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  24.51 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.91 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1629  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.58 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.28745  normal  0.836874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.91 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  25.47 
 
 
207 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>