28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2504 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  73.64 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.81 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.96 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.17 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  35.54 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  36.36 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.54 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.4 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  36.7 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  29.03 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  32.73 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  34.23 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  29.52 
 
 		 461 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.52 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  28.57 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  36.71 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  33 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  35.77 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1629  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.36 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.28745  normal  0.836874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  35.19 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.88 
 
 		 537 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  30.53 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  31.63 
 
 		 207 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2090  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.64 
 
 		 189 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 		 201 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>