20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  50.53 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  48.03 
 
 		 148 aa  121  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  41.12 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  37.84 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  38.54 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  33.94 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  35.04 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  36.11 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  33.65 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.45 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  31.86 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  40.7 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  33.65 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  31.3 
 
 		 117 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  31.93 
 
 		 119 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  35 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  40 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>