32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0804 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  53.91 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  51.79 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  43.22 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  46.79 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  40.16 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  47.17 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  38.98 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  42.16 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  42.42 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.38 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  35.78 
 
 		 245 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  32.73 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  37.11 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  31.43 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.38 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  31.9 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  32.69 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  31.58 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  37.84 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  25.44 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  42.86 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  32.08 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  35.09 
 
 		 200 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  36.23 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.21 
 
 		 592 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  32.29 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  32.29 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  44.74 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>