32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1744 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1744  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  100 
 
 		 129 aa  263  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.599572  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0027  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  45.6 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0361  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  50 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.734213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2727  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  47.54 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4117  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1621  ech hydrogenase subunit D  42.28 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0804  hypothetical protein  40.16 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1085  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  46.6 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00876036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1733  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  42.06 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00717333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2504  ech hydrogenase, subunit EchD, putative  35.54 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3021  ech hydrogenase subunit D  43.12 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.819366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3368  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.79 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  38.83 
 
 		 461 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0149  ech hydrogenase subunit D  45.74 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1521  hypothetical protein  36.13 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  38.78 
 
 		 461 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0552  hypothetical protein  37.08 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1101  hydrogenase subunit, putative  33.33 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.73 
 
 		 461 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13370  hypothetical protein  37.84 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1573  hypothetical protein  36.63 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.117388 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07250  hypothetical protein  31.13 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1670  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.82 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.37 
 
 		 580 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.49 
 
 		 486 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  35.48 
 
 		 213 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  36.36 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.99 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  38.18 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  28.57 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  36.84 
 
 		 200 aa  40  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  46.34 
 
 		 593 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>