56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3335 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3335  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  927    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4618  hypothetical protein  36.58 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1995  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.64 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374218  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6836  hypothetical protein  30.26 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3184  hypothetical protein  31.78 
 
 		 185 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5183  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369158  normal  0.0210089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5093  hypothetical protein  31.73 
 
 		 106 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.322751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4154  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  34.78 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0356  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.57 
 
 		 603 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 724 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.41 
 
 		 786 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 		 783 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0349  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.71 
 
 		 599 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  31.51 
 
 		 786 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.11 
 
 		 787 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  35.06 
 
 		 764 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  32.89 
 
 		 735 aa  47  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.38 
 
 		 783 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 840 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  29.45 
 
 		 790 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 1082 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 787 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 		 1060 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 643 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.52 
 
 		 787 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 787 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  43.4 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 846 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 787 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.73 
 
 		 1199 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  38.71 
 
 		 1135 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 731 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  37.97 
 
 		 702 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  30.86 
 
 		 1189 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 		 787 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  44.9 
 
 		 736 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 556 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1579  UvrD/REP helicase  31.43 
 
 		 989 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.63 
 
 		 757 aa  43.5  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  33.75 
 
 		 630 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  24.12 
 
 		 774 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.51 
 
 		 1186 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 557 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>