23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4618 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  970    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3335  hypothetical protein  35.94 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1995  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.81 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3184  hypothetical protein  46.77 
 
 		 185 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5183  hypothetical protein  46.77 
 
 		 146 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369158  normal  0.0210089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5093  hypothetical protein  46.77 
 
 		 106 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  38.3 
 
 		 769 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  26.74 
 
 		 890 aa  46.6  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  22.46 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 757 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  44.19 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  43.18 
 
 		 783 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.22 
 
 		 745 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.13 
 
 		 743 aa  44.7  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  32.35 
 
 		 1003 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.54 
 
 		 849 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  21.98 
 
 		 689 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  40.82 
 
 		 778 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  20.94 
 
 		 689 aa  43.9  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.62 
 
 		 715 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 751 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  38.78 
 
 		 789 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 751 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>