26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1995 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1995  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 504 aa  1024    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3335  hypothetical protein  33.64 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4618  hypothetical protein  25.81 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4111  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 827 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  50.91 
 
 		 553 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 1032 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3055  UvrD/REP helicase  39.47 
 
 		 608 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  38.2 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3048  UvrD/REP helicase  39.47 
 
 		 608 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0267526  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3829  hypothetical protein  28.97 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.322751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2792  DNA helicase II  29.03 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.336571 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4971  DNA helicase II  29.03 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146307 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4275  UvrD/REP helicase  41.38 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0143761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  37.1 
 
 		 1075 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0295  hypothetical protein  22.22 
 
 		 629 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  32.98 
 
 		 687 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  42.11 
 
 		 1715 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 1132 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  40.62 
 
 		 759 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  21.61 
 
 		 627 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 569 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  36.84 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 697 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003290  DNA helicase  21.88 
 
 		 634 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4281  UvrD/REP helicase  37.04 
 
 		 606 aa  43.5  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  39.06 
 
 		 766 aa  43.5  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>