More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1579 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1579  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 989 aa  1906    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1061 aa  223  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.44 
 
 		 1204 aa  152  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.93 
 
 		 1262 aa  124  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  29.78 
 
 		 1196 aa  121  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.81 
 
 		 671 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  21.02 
 
 		 1124 aa  118  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  24.97 
 
 		 1226 aa  118  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  24.82 
 
 		 1061 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 668 aa  116  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1921  UvrD/REP helicase  26.93 
 
 		 959 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.74 
 
 		 667 aa  114  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 1080 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.24 
 
 		 1186 aa  110  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1714  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 948 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.02 
 
 		 1241 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  25.21 
 
 		 723 aa  108  5e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.41 
 
 		 1230 aa  107  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.13 
 
 		 1241 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.13 
 
 		 1241 aa  107  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05980  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  28.37 
 
 		 1104 aa  106  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.02 
 
 		 1241 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.15 
 
 		 1240 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  23.13 
 
 		 1241 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  23.13 
 
 		 1241 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.74 
 
 		 1241 aa  105  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.26 
 
 		 1121 aa  103  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 685 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  20.94 
 
 		 945 aa  101  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2512  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 1192 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.88 
 
 		 671 aa  100  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  24.69 
 
 		 1180 aa  99.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 		 680 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  28.07 
 
 		 671 aa  97.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 663 aa  97.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  24.58 
 
 		 1180 aa  95.9  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 1149 aa  96.3  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 662 aa  95.5  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.19 
 
 		 662 aa  95.5  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.69 
 
 		 1241 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  24.89 
 
 		 672 aa  94.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 1066 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 732 aa  94  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  22.1 
 
 		 1248 aa  94  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  26.93 
 
 		 1107 aa  94.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.08 
 
 		 1217 aa  93.6  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 735 aa  93.2  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 677 aa  93.2  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  23.33 
 
 		 1241 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.74 
 
 		 715 aa  93.2  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 620 aa  92.8  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  22.26 
 
 		 1217 aa  92.4  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 648 aa  92  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 648 aa  92  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  22.26 
 
 		 1217 aa  92.4  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  23.6 
 
 		 1242 aa  92  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.42 
 
 		 672 aa  92  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  22.55 
 
 		 1233 aa  91.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  22.85 
 
 		 1207 aa  91.7  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  24.14 
 
 		 923 aa  91.7  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.74 
 
 		 1218 aa  91.3  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 669 aa  91.3  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1057 aa  90.9  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 731 aa  90.9  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.87 
 
 		 671 aa  90.9  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.46 
 
 		 706 aa  90.5  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.81 
 
 		 858 aa  90.5  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.29 
 
 		 773 aa  90.9  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 710 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 		 706 aa  90.1  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 787 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.75 
 
 		 730 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.88 
 
 		 1282 aa  90.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  24.87 
 
 		 1242 aa  90.1  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.34 
 
 		 1168 aa  89.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.7 
 
 		 674 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  24.96 
 
 		 669 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  24 
 
 		 656 aa  89.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.27 
 
 		 685 aa  89.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.56 
 
 		 731 aa  89  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.52 
 
 		 690 aa  89  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.37 
 
 		 682 aa  88.6  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  28.19 
 
 		 665 aa  88.6  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.41 
 
 		 671 aa  88.6  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.37 
 
 		 765 aa  88.2  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.87 
 
 		 707 aa  88.2  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.32 
 
 		 671 aa  88.2  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.7 
 
 		 674 aa  87.8  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.11 
 
 		 678 aa  87.8  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.7 
 
 		 674 aa  87.8  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.7 
 
 		 674 aa  87.8  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 809 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.25 
 
 		 669 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 		 984 aa  87  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.71 
 
 		 674 aa  87  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 		 1115 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.54 
 
 		 763 aa  87.4  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.82 
 
 		 1111 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  24.78 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  27.36 
 
 		 709 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>