More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2611 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  75.74 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  75.74 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  75.74 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  75.74 
 
 		 184 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  79.07 
 
 		 273 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  75 
 
 		 273 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  75 
 
 		 289 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  65 
 
 		 233 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  71.3 
 
 		 150 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  54.03 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  79.31 
 
 		 58 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  77.59 
 
 		 58 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  40.21 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  40.21 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  40.21 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  40.21 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01380  integrase core domain protein  63.64 
 
 		 60 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  35.83 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  34.88 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  34.88 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  34.88 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  34.88 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  34.88 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  37.65 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  37.65 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  37.65 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  36.36 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  36.36 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  36.36 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  34.69 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  33.06 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  35.65 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  36.63 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  35.87 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  35.48 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  36.52 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  34.78 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  38.1 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  38.04 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  38.04 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  38.04 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  38.04 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  39.25 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  39.25 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5965  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  31.43 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  37.37 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  38.32 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  38.32 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  37.76 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  37.76 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  37.76 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  37.76 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  37.76 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  34.92 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  36.89 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  37.38 
 
 		 279 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  34.71 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  36.36 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  34.13 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  32.56 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  36.36 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4648  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  32.56 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>